三十六難（三十六難次節誤列三十七難末節）曰：
臟各有一耳，腎獨有兩者，何也？
然，腎兩者，非皆腎也。其左者為腎，右者為命門。
命門者，諸神精之所舍，原氣之所系也；男子以藏精，女子以系胞。故知腎有兩（兩諸本作一）也。
此章承上章。復發明命門在於兩腎中間之義。所以又補出原氣之所系也。蓋所謂原者。即三焦之原。六十六難云：臍下腎間動氣者。人之生命也。故名曰：原。觀此亦可以無疑矣。但後人不明此義。將謂三焦與胞絡爲表裏。出自內經。一陰一陽之定耦。初無命門三焦表裏之說。惟靈樞根結及素問陰陽離合等篇。有太陽根於至陰。結於命門。命門者。目也。此指太陽經穴終於睛明。睛明所夾之處。是腦心乃至命之處。故曰命門。此外幷無命門之說。而右腎爲命門。實見於此。但難經皆出於內經。必有確據。誠如滑氏之注七難云：篇首有《經》言：二字。考之靈素幷無。或越人時別有上古之本。是未可知也。惟是右腎爲命門。男子藏精。女子系胞。則腎將藏何物。此又無怪乎其疑也。觀經脈篇。有左爲腎。右爲子戶。夫所謂子戶者。即子宮也。即俗名子腸也。子腸居直腸之前。膀胱之後。當關元氣海穴之間。男精女血。皆存乎此。曰丹田。曰氣海。實則一子宮耳。子宮之下有一門。女子曰産門。男子即泄精之道。男之施由此門而出。女之攝由此門而入。胎元既足。複由此而出。即如四十四難。七衝門者。皆指出入之處。乃見凡出凡入皆謂之門。而此系先天立命之本。焉得不謂之命門乎。是即男子藏精。女子系胞。皆有歸著。正合六十六難臍下腎間動氣之說。而千古之疑可頓釋矣。至於十二經之陰陽表裏。固已天然配就。若以命門再配一經。是腎臟唯一。而經居其二。必無是理。且內經有督脈十椎中是命門原。屬於腎之句。當以原字讀斷。則知命門在原。幷知兩腎俱非藏精系胞之所。其天一之真陰。藏於兩腎中間。命門之原。而氣通於左。坎中之真陽。藏於兩腎中間。命門之原。而氣通於右。故左腎爲水。右腎爲火。越人以命門之真陽。分發右尺臣火之位。理宜然也。予亦悉揣經義而評之。以俟將來之裁正焉。
中峰云：論命門之原。十二經之根。呼吸之門。三焦之原。豈非指此命門乎。
《經》言：氣獨行於五臟，不營於六腑者，何也？
然，
夫氣之所行也，如水之流，不得息也。
故陰脈營於五臟，陽脈營於六腑，如環無端，莫知其紀，終而復始，其不覆溢，人氣內溫於臟腑，外濡於湊理。
此節言人身命門之氣。無不流通。但陰脈獨榮五臟。陽脈獨榮六腑耳。陰脈者。三陰脈也。
陽脈者。三陽脈也。循環無已。行於五臟六腑。而不覆溢者。謂不傾而不滿也。又曰：人氣內溫於臟腑。外濡於腠理者。言人命門一陽之氣。內則溫養臟腑。外則濡潤腠理。無微不到。無處不周。而所問之不榮於六腑者。惟陰脈耳。非氣也。故下文詳言陰脈陽脈之病。覆溢二字。幷非寸口脈之覆溢。舊注指十八難之覆溢脈。大誤。
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